chem office

ChemDraw pro versi 8.0 merupakan salah satu program aplikasi dari Chem Office, untuk menggambar struktur 2D dalam bidang ilmu kimia, terutama kimia organik, biokimia, dan polimer. Software ini dapat membantu anda dalam menggambar struktur kimia dengan berbagai fasilitasnya, hanya dengan mengkliknya, tool tersebut akan bekerja untuk anda.

Tool-tool dalam ChemDraw mewakili berbagai macam bentuk ikatan yang dapat anda susun menjadi struktur kimia sehingga tidaklah sulit bagi anda untuk menggambarkan struktur yang kompleks sekalipun, bahkan juga dalam berbagai bentuk konformasi dan dalam bentuk proyeksi.

chemDraw merupakan program aplikasi untuk menggambar yang di lengkapi dengan tool-tool sehingga pengguna dapat dengan mudah membuat gambar yang diinginkannya hanya dengan mengklik tool-tool tersebut, dengan ChemDraw anda tidak akan mengalami kesulitan di dalam membuat struktur kimia. Hal ini tentu sangat membantu anda dalam menulis skripsi, thesis, karya ilmiah, ataupun jurnal, bahkan anda juga dapat mengkomunikasikan struktur yang anda miliki ke dunia web jika komputer anda di lengkapi dengan program aplikasi ChemOffice yang lain. Gambar yang telah anda buat juga dapat dengan mudah dicetak atau dibawah ke dalam program aplikasi lain seperti Ms. Word.

ChemDraw juga dapat menganalisis struktur kimia yang telah kita gambar dengan menggunakan Analys Struktur pada menu Structure, di sini anda dapat mengetahui sifat-sifat fisik struktur tersebut, misalnya, titik didih, titik leleh, berat molekul, temperatur, tekanan, dll.

source:http://networkedblogs.com

Kimia Komputasi dalam Pengembangan Obat

Metode kimia komputasi untuk tujuan disain molekul baru, tetutama senyawa obat, serta prediksi sifat fisiko-kimia telah menjadi metode pilihan utama sebagian besar industri farmasi berkaitan dengan pengembangan maupun penemuan obat. Aplikasi metode yang juga disebut in silico ini, berawal dari postulat dasar dalam paradigma disain obat klasik yang menyatakan bahwa efek obat dalam tubuh manusia merupakan suatu konsekuensi “molecular recognition” antara ligan (dalam hal ini obatdan sutau makromolekul (target).

Aktivitas farmakologi ligan terhadap dudukan kerjanya (action site) sangat ditentukan oleh tatanan ruang dan kerapatan elektron atom-atom ligan, dan juga bagaimana atom-atom tersebut berinteraksi dengan molekul target atau “biological conterpart” (Bohm & Klebe, 1996). Struktur, dinamika, dan interaksi demikian memungkinkan suatu karakterisasi menggunakan kimia komputasi dilakukan. Misalnya, pendekatan berbasis mekanika molekular (molecular mechanics) secara efisien dapat membantu penemuan kandidat-kandidat obat baru, dan metode komputasi yang tidak mahal ini sekarang secara rutin digunakan di dalam disain obat (Jorgensen, 2004).

Meskipun demikian, jika deskripsi sifat elektron yang diperlukan untuk tujuan disain tersebut, maka penggunaan mekanika kuantum sangat beperan. Sesungguhnya pendekatan kimia komputasi berbasis mekanika kuantum selain menjelaskan efek elektronik kuantum, juga mampu menjelaskan pembentukan dan pemutusan ikatan kimia, efek polarisai, perpindahan muatan, dst., biasanya mampu memperkirakan energi molekul lebih akurat (Cavali et al., 2006). Aplikasi mekanika kuantum berbasis ligan di dalam disain obat sejak dahulu telah diarahkan dalam pengamatan energi, geometri, dan distribusi elektron (misalnya HOMO, LUMO, momen dipol, dst.) molekul organik kecil. Perhitungan mekanika kuantum secara rutin telah juga dilakukan dalam analisis QSAR (Quantitative-Structure Activity Relationship) klasik (Lepp & Chuman, 2005), QSAR 3D (Aguirre et al., 2005) dan juga mengembangkan deskriptor kuantum (Wan et al., 2004) untuk digunakan dalam penelitian korelasi struktur-aktivitas.

Hal menarik dalam penggunaan kimiakomputasi berkaitan dengan molekul target di dalam disain obat adalah telaah analisis reaksi enzimatik dalam sistem biologis yang memiliki relevansi farmakologi (Gogonea et al., 2001), simulasi ini memungkinkan menjelaskan mekanisme substrat (inhibitor)-enzim dan lebih lanjut terhadap interaksi substrat enzim pada keadaan transisi melalui analisis energi ikat (binding energy).

perkembangan kimia komputasi

Perkembangan kimia komputasi yang sangat pesat dimulai pada tahun 1950- telah mengubah diskripsi suatu sistem kimia dengan masuknya unsur baru di antara eksperimen dan teori yaitu eksperimen komputer (Computer Experiment), dalam eksperimen komputer, model masih tetap menggunakan hasil dari pakar kimia teoritis, tetapi perhitungan dilakukan dengan komputer berdasarkan atas suatu "resep", algoritma yang dituliskan dalam bahasa pemograman. Keuntungan dari metode ini adalah dimungkinkan menghitung sifat molekul yang kompleks dan hasil perhitungannya berkorelasi secara signifikan dengan data eksperimen.

Perkembangan eksperimen komputer mengubah secara substansial hubungan tradisional antara teori dan eksperimen. Simulasi membutuhkan suatu metode yang akurat dalam memodelkan sistem yang dikaji. Simulasi sering dapat dilakukan dengan kondisi yang sangat mirip dengan eksperimen sehingga hasil perhitungan kimia komputasi dapat dibandingkan secara langsung dengan eksperimen, jika hal ini terjadi, maka simulasi bersifat sebagai alat yang sangat berguna, bukan hanya untuk memahami dan menginterpretasi data eksperiment dalam tingkat mikroskopik, tetapi dapat juga mengkaji bagian yang tidak dapat dijangkau secara eksperiment, seperti reaksi pada kondisi tekanan yang sangat tinggi atau reaksi yang melibatkan gas berbahaya.

Penelitian kimia dengan alat komputer pada era 1950-an dimulai dengan kajian hubungan struktur kimia dengan aktivitas fisiologi dari senyawa. Salah satu ahli kimia yang berjasa besar dalam bidang ini adalah John Pople yang berhasil mengkonversi teori-teori fisika dan matematika ke dalam kimia melalui program komputer. Metode kimia komputasi memungkinkan para kimiawan melakukan penentuan struktur dan sifat suatu sistem kimia dengan cepat. Bidang yang sangat terbantu dengan berkembang kimia komputasi adalah bidang kristalografi.

Dua peneliti dalam bidang kimia komputasi telah memenangkan Nobel bidang sains pada tahun 1998 yaitu Walter Kohn dengan teori fungsional kerapatan (Density Functional Theory, DFT) dan John A. Pople yang telah berjasa dalam mengembangkan metode komputasi dalam kimia kuantum, mereka telah memberi peluang para kimiawan mempelajari sifat molekul dan interaksi antara molekul. John Pople telah mengembangkan kimia kuantum sebagai suatu metode yang dapat digunakan oleh hampir semua bidang kimia dan membawa kimia ke dalam era baru yaitu eksperimen dan teori dapat bekerja bersama dalam mengeksplorasi sifat sistem molekular. Salah satu produk program komputasi kimia yang dihasilkan oleh Pople adalah GAUSSIAN.

Tahun belakangan ini dapat dilihat kenaikan jumlah orang yang berkerja pada kimia teori, kebanyakan peneliti ini adalah teoretikus kerja paruh waktu yaitu mereka yang sudah bekerja pada bidang kimia selain kimia teori. Kenaikan jumlah peneliti di bidang kimia teori ini ditunjang oleh perkembangan kemampuan komputer dan perangkat lunak yang semakin mudah digunakan, hal ini menyebabkan banyak orang yang melakukan perkerjaan di bidang kimia komputasi, walaupun tanpa mempunyai pengetahuan cukup tentang bagaimana perhitungan kimia itu dijalankan oleh komputer, sebagai hasilnya, banyak orang yang tidak mengetahui bahkan penjelasan yang sangat mendasar sekalipun tentang bagaimana perhitungan dijalankan sehingga pekerjaan yang dihasilkan dapat merupakan hasil yang sesunguhnya atau hanya berupa "sampah".

source:http://faijalchemistry.blogspot.com

Manfaat kimia dalam pembelajaran

Manfaat Kimia Komputasi untuk Pembelajaran

1. Dapat menghitung sifat molekul yang kompleks dan hasil perhitungannya berkorelasi secara signifikan dengan eksperimen.

2. Dapat sebagai alat hitung –seperti halnya kalkulator- untuk membantu penyelesaian secara numerik dari persamaan matematika yang menggambarkan sifat sistem, misalnya dalam penyelesaian perhitungan stokiometri, termasuk juga otomatisasi alat ukur yang dapat mengkonversi signal elektronik menjadi data numerik.

3. Dapat sebagai alat visualisasi dan animasi

4. Membantu kita mengeksplorasi sifat senyawa dan pada umumnya program tersebut telah dilengkapi dengan visualisasi dan animasi, seperti program HyperChem, Gaussian, Turbomol, Rasmol dll.

5. Menghitung sifat-sifat molekul dan perubahannya maupun melakukan simulasi terhadap sistem-sistem besar (makromolekul seperti protein atau sistem banyak molekul seperti gas, cairan, padatan, dan Kristal cair), dan menerapkan program tersebut pada sistem kimia nyata.


6. Simulasi terhadap makromolekul (seperti protein dan asam nukleat) dan sistem besar bisa mencakup kajian konformasi molekul dan perubahannya (mis. Proses denatrasi protein), perubahan fasa, serta peramalan sifat-sifat makroskopik (seperti kalor jenis) berdasarkan perilaku di tingkat atom.


source:www.scribd.com

Istilah istilah dalam kimia komputasi

1.ab initio
Istilah “ab initio” berasal dari bahasa latin yang diberikan untuk
menandai perhitungan yang diturunkan secara langsung dari prinsip-prinsip
teoritis, tanpa memasukkan data eksperimen. Ab initio mengacu pada
perhitungan mekanika kuantum melalui beberapa pendekatan matematis,
seperti penggunaan persamaan yang disederhanakan (Born-Oppenheimer
approximation) atau pendekatan untuk penyelesaian persamaan differensial
2.Semi empiris
Perhitungan semiempiris disusun dengan cara yang secara umum
sama dengan perhitungan HF. Beberapa perhitungan, seperti integral
elektron ganda diselesaikan dengan cara pendekatan atau sama sekali
dihilangkan. Sisi baik dari perhitungan semiempiris adalah mereka lebih cepat
daripada perhitungan ab initio. Sisi buruk dari perhitungan semiempiris
adalah hasilnya sangat bergantung pada tersedianya parameter yang sesuai
dengan molekul yang dianalisis.
3.Mekanika Molekuler
Metoda yangdikenal dengan mekanika molekular menyediakan pernyataan aljabar yang
sederhana untuk energi total senyawa, tanpa harus menghitung fungsi
gelombang atau kerapatan elektron total.
4.Molecular modeling
suatu metode untuk merancang dan menganalisis struktur dan sifat-sifat molekul tertentu dengan mengunakan teknik kimia komputasional dan teknik visualisasi grafis yang bertujuan untuk menyediakan struktur geometri tiga dimensi yang sesuai dengan parameter kondisi yang telah ditentukan. 

2.       5.Molecular docking  

      suatu teknik yang digunakan untuk mempelajari interaksi yang terjadi dari suatu kompleks molekul.Molecular docking dapat memprediksikan orientasi dari suatu molekul ke molekul yang lain ketika berikatan membentuk kompleks yang stabil
    6. Kimia kuantum 

      sebuah aplikasi mekanika kuantum pada kimia. Kimia kuantum memungkinkan kita untuk memahami dan memprediksi struktur, sifat dan mekanisme reaksi dari berbagai bahan. 
    7.Mekanika statistik 

       adalah cara matematika untuk mengekstrapolasi sifat termodinamika dari materi secara keseluruhan (bulk) berpijak pada gambaran molekular dari sistem kimia. 
    8.Visualisasi data 

        proses menampilkan informasi dalam jenis representasi piktorial atau grafis. Sejumlah program komputer yang sekarang tersedia untuk menerapkan skema pewarnaan data atau bekerja dengan tiga dimensi representasi. 
    9. Orbital Gaussian atau Gaussian type orbitals (GTOs)

        fungsi matematika yang menyatakan orbital atom dalam perhitungan orbital molekul. Istilah ini umum       

        digunakan dalam kimia komputasi. 
    10.OV (Orbital Viewer) 

      perangkat lunak gratis untuk menggambarkan orbital atom dan molekul, membuat animasi maupun untuk melihat penampang lintang (struktur dalam) orbital. Dapat pula dibuat gambar 3D (yang dapat dilihat dengan kacamata 3D sperti yang digunakan untuk melihat sinetron 3D). 

     11.  BS (Balls & Sticks)

      perangkat lunak gratis untuk menggambarkan struktur kimia, terutama kristal, dalam 3D dan dapat menghasilkan gambar bitmap yang dapat disalin ke clipboard dan ditempelkan (paste) di dokumen pengolah kata (Word misalnya).

     12. Molecular Operating Environment (MOE) 

     dikembangkan Chemical Computing Group. MOE selain menawarkan fasilitas yang cukup lengkap juga user-friendly sehingga cocok digunakan dalam pembelajaran. Hanya saja aplikasi kimia komputasi yang user-friendly biasanya mahal sehingga alasan efisiensi biaya tidak lagi relevan.
     

     

13.Perbandingan analisis lapangan molekul (CoMFA): teknik QSAR 3D berdasarkan data dari molekul aktif yang dikenal
14.Kimia komputasi: cabang kimia yang menggunakan prinsip-prinsip ilmu komputer untuk membantu dalam memecahkan masalah kimia
15. Ilmu komputer: studi tentang dasar-dasar teoritis dari informasi dan komputasi. Ini juga mencakup teknik-teknik praktis untuk implementasi dan aplikasi dalam sistem komputer
16. Teori fungsional kepadatan (DFT): metode mekanis kuantum pemodelan yang digunakan dalam fisika dan kimia untuk menyelidiki struktur elektronik dari sistem banyak-tubuh
17. Hartree-Fock: metode perkiraan untuk penentuan fungsi gelombang tanah negara dan tanah-keadaan energi dari sistem banyak-tubuh kuantum
18. Hybrid fungsional: kelas perkiraan untuk pertukaran energi-korelasi fungsional dalam teori kerapatan fungsional yang menggabungkan sebagian pertukaran tepat dari Hartree-Fock teori dengan pertukaran dan korelasi dari sumber lain
19. Kombinasi linear orbital atom (LCAO): superposisi kuantum orbital atom dan teknik untuk menghitung orbital molekul
20.Slater tipe orbital: fungsi yang digunakan sebagai orbital atom dalam kombinasi linear orbital atom orbital molekul metode

peetunjuk penggunaan hyperchem

Seketika HyperChem aktif, maka tampak toolbars standard berikut:

 

Beberapa toolbars yang harus dipahami dulu adalah Draw, Select, Rotate out-of-plane (XY Rotation), Rotate in-plane (Z Rotation), Translate (XY Translation), Z-Translate, Magnify/shrink/Zoom,Z-Clipping planes, dan Text Annotation. Penjelasannya sebagai berikut:

: button `Drawing' untuk menampakkan sistem periodik unsur; cara melakukanya

                          Dengan klik 2 kali secara cepat

: button `Selection' untuk memilih atom atau molekul atau untuk melihat panjang ikatan, sudut ikatan, dan sudut torsi

: button `XY Rotation' untuk memutar molekul sekitar sumbu X dan Y

: button `Z Rotation' untuk memutar molekul sekitar sumbu Z

: button `XY Translation' untuk menggerakkan atom dan molekul sepanjang sumbu

  X dan Y                   

: button `Z Translation' untuk menggerakkan atom dan molekul sepanjang sumbu Z

                       

: button `Zoom' untuk membesarkan atau mengecilkan sistem molekul. Caranya, tekan tombol kin mouse, gerakan ke kiri-bawah untuk membesarkan, atau gerakan ke kanan-atas untuk mengecilkan

: button `Z Clipping' untuk memotong molekul

: button `Text Annotation' untuk menambakkan text pada layar

PERSIAPAN MEMBUAT FILE STRUKTUR BARU

Langkah sederhananya :

Klik <File>, pilih <Preferences>, sehingga muncul tampilan berikut

Pilih pada <Window Color> <White>, supaya layar HyperChem berwarna putih.

Pilihan lain pada <Preferences> dapat dicoba sendiri.

Klik <Display>, pilih <Labels>, sehingga muncul tampilan berikut:

Pada <Labels> pilihlah <Symbol> dalam <Atoms>, lalu pilihlah <Bond Order> dalam Bonds>. Sementara pilihan manut dulu, lain kali terserah.

MEMBUAT STRUKTUR BARU

Langkah mudahnya:

Klik <File> lalu pilih <New>, supaya layar bersih

Klik button  [Draw]    2 kali dengan cepat sehingga muncul < Element Tabel>

Seumpama akan membuat struktur etana (CH₃CH₃), maka klik I kali huruf <C> pada <Element Tabel>. Ingat pilihan <Explicit Hydrogens> pada <Element Tabel> jangan dicentang (tidak dipilih dulu)

Pada layar putih klik kiri mouse 1 kali, kemudian klik kiri mouse I kali lagi dekat dengan yang pertama, seperti pada gambar

Klik kiri mouse pada C sebelah kiri, jangan dilepas dulu klik kirinya, geser atau hubungkan ke C yang kedua, sehingga terbentuk ikatan, seperti gambar berikut

Bagaimana membuat etena (CH2CH2) yang orde ikatannya 2 ? 1.      Lakukan langkah (1) sampai (5) seperti di atas, persis! 2.      Klik button toolbars [Draw] 1 kali, lalu arahkan kursor bertanda <select> dan tempatkan tepat pada garis ikatan, klik kiri mouse 1 kali saja, maka akan muncul ikatan ganda. Untuk membuat etuna (CHCH) yang berorde ikatan 3, maka lakukan klik seperti ini 2 kali klik kiri mouse, sehingga muncul ikatan tripel. 3.      Baru lalukan langkah (6) dan (7).

Klik <Build> dan pilihlah <Add H & Model Build> sehingga muncul struktur berikut

Klik button toolbars yang lain untuk mengubah posisi stuktur, misalnya klik 1 kali button [XY Rotation]  , kemudian pada layar putih klik kiri mouse dan tahan tents sambil menggeser mouse kesana-kemari. Coba pilihan lain, misal [translation], dan [zoom]

MELIHAT PANJANG IKATAN, SUDUT IKATAN, DAN SUDUT TORSION

Klik <Select> dan pilihlah <Atoms>, untuk memilih atom-atom

Klik button toolbars [Select]    1 kali saja

Untuk melihat panjang ikatan, arahkan button [Select] pada garis ikatan tertentu, misalnya garis ikatan antar C, dan klik kiri mouse l kali tepat pada garis ikatan yang dipilih, maka akan muncul keterangan pada garis paling bawah layar seperti berikut ini

Jarak antar C adalah 1,54 Angstrom

Cobalah lagi pada garis ikatan lain, dan bacalah panjang ikatannya!

Untuk membebaskan kursor mouse dan memilih maka klik kanan mouse 1 kali di sembarang tempat.

4. Untuk melihat sudut ikatan H-C-H, maka klik kiri mouse dan tahan tepat di atas atom H pertama dan geserkan ke atom H kedua, lepaskan klik, dan lihat hasilnya.

Sudut antara atom nomer 6-2-7 (H-C-H) adalah 109,471°.

Coba antar 3 atom yang lain ! Misal sudut H-C-C !

5. Untuk melihat sudut torsi atom H-C-C-H, maka klik kiri mouse pada atom H pertama, tahan klik dan geserkan ke atom H kedua, sehingga muncul gambar berikut

Sudut torsi atom H-C-C-H adalah 180°

STRUKTUR 3 DIMENSI

Klik <Display>, dan pilihlah <Rendering>, muncul tampilan berikut

Pada Rendering Options terdapat berbagai pilihan : Rendering Method, Sticks, Balls, Cylinders, dan Overlapping Spheres. Misalkan pilihannya pada

Rendering Method      : Balls and Cylinder

Sticks  : Pilih semua, kecuali Stereo

Balls    : Shading dan Highlight

Cylinder          : Color by element

Overlapping Sphere    : Shading dan Highlight

Maka akan diperoleh gambar 3 dimensi sebagai berikut:

Untuk berubah ke bentuk semula (misalnya Sticks) tinggal tekan tombol <F2>, bolak-balik!

Perlakukan bentuk gambar 3 dimensi ini seperti bentuk <Sticks>, misalkan untuk melihat panjang ikatan, sudut ikatan 3 atom, dan sudut torsi 4 atom pilihan. Gerakkan pula dengan <XY Rotation>, <Z Rotation>, <Translation>, atau <Zoom>

Untuk melihat gambar 3 dimensi yang bagus banget, maka klik <Display> dan pilihlah <Raytrace>

Jangan lupa simpan gambar strukturnya dengan memilih <File> dan <Save>, kemudian beri nama file (misal gambar 1).

MENGUBAH STRUKTUR MOLEKUL

Bagaimana membuat struktur Toluena dengan mengubah dari Benzena ?

Klik menu <File>, pilih <Open>, carilah file `Benzene' di direktori C:\Hyper80\ Samples\aromatic

Klik file `Benzene' dan <Open>, maka akan muncul struktur Benzena

Klik menu <Select> dan pilih <Atoms>, ingat jangan pilih dulu <Multiple Selections>, karena hanya akan memilih satu pilihan saja

Klik kiri mouse tepat di atas salah satu atom H sampai ada tanda lingkaran, tanda berhasil memilih, kemudian pilih tombol <Delete> pada keyboard

Klik button [Draw]  2 kali dengan cepat sehingga muncul <Element Tabel>

Klik 1 kali huruf <C> pada <Element Tabel>

Klik kiri mouse l kali tepat pada posisi atom H yang dihapus

Tarik garis ikatan dari atom C baru ke atom C yang dihilangkan atom H-nya, dengan cara menekan tombol kiri mouse tepat di atas atom C baru, tahan dan geserkan ke atom C yang hilang atom H-nya

Klik <Build> dan pilihlah <Add H & Model Build>

Klik button [XY Rotation]    dan gerakan molekul sehingga atom H yang lain tampak

source:http://kimia.unnes.ac.id/kasmui/komputasi/diktat_hyper.htm
 

MENGENAL HYPERCHEM

Apa itu HyperChem?

            HyperChem^Ò ialah suatu program simulasi dan pemodelan molekular yang memung-kinkan perhitungan kimiawi yang kompleks. HyperChem mencakup fungsi-fungsi berikut:

1.      Membuat sketsa dwimatra (2D) molekul dari atom-atom penyusunnya, lalu mengubahnya menjadi model trimatra (3D) dengan HyperChem Model Builder.

2.      Memilih residu-residu standar secara berurutan dari perpustakaan asam amino dan nukleotida HyperChem/Lite untuk membangun protein dan asam nukleat.

3.      Membaca tipe atom dan koordinat molekular yang telah disimpan sebagai arsip HIN (masukan HyperChem yang dibuat sebelumnya) atau arsip ENT (mengambil dari sumber lain, yaitu Brookhaven Protein Data Bank/PDB)

4.      Menata kembali molekul, misalnya dengan memutar atau menggesernya.

5.      Mengubah kondisi tampilan, termasuk penampakan ruang, model molekul, dan label struktural.

6.      Merancang dan melakukan perhitungan kimiawi, termasuk dinamika molekular.

Tersedia berbagai metode mekanika molekular maupun mekanika kuantum (semiempiris atau ab initio). Perhitungan mekanika molekular menggunakan medan gaya MM+, AM-BER, BIO+, atau OPLS, sedangkan mekanika kuantum semiempiris meliputi extended Hückel, CNDO, INDO, MINDO3, MNDO, AM1, PM3, ZINDO/I, dan ZINDO/S.

7.      Penetapan efek isotop dalam perhitungan analisis vibrasional untuk metode-metode SCF ab initio dan semiempiris.

8.      Membuat grafik Excel dari hasil perhitungan kimiawi.

9.      Mensolvasikan molekul dalam kotak periodik.

HASIL PERHITUNGAN DENGAN HYPERCHEM

Prediksi:

            HyperChem dapat digunakan untuk menentukan bebe-rapa sifat struktur antara lain :

·   Stabilitas relatif dari beberapa isomer ·   Panas pembentukan ·   Energi aktivasi ·   Muatan atom ·   Beda energi HOMO-LUMO ·   Potensial Ionisasi ·   Afinitas elektron ·   Momen dipol ·   Tingkat energi elektronik ·   Energi korelasi elektron MP2

·   Energi keadaan tereksitasi CI ·   Sifat dan struktur keadaan transisi ·   Energi interaksi non-bonded ·   Spektra serapan UV-VIS ·   Spektra Absorpsi IR ·   Pengaruh isotop pada vibrasi ·   Spektra serapan IR ·   Efek Collision pada sifat struktur ·   Stabilitas dari kluster

Simulasi

• Interaksi Docking
• Pengaruh temperatur pada gerakan molekul
• Pengaruh pelarut pda struktur dan dinamika
• Interaksi intermolekular pada kluster