Software Kimia Komputasi

Pengguaan perangkat lunak memang telah menyentuh aspek kehidupan.Mulai dari bisnis,konstruksi,hingga di bidang sains.Software talah membantu para peneliti,mahasiswa,pelaku bisnis,dll dalam berbagai aktivitas masing masing.

Bila di dunia bisnis kita mengenal software SAP dan Oracle,di bidang konstruksi kita mengenal
Bagaimana dengan di bidang sains khususnya kimia ?

Berikut adalah beberapa aplikasi yang bisa digunakan untuk mendukung pembelajaran kimia. Diberikan sedikit paparan dan tautan untuk menuju sumber utamanya sehingga bisa di-download di komputer. Banyaknya aplikasi visualisasi molekul ini tentu menjadikan kita punya banyak pilihan disesuaikan dengan kenyamanan masing-masing pengguna.

Mari kita berkenalan dengan beberapa software kimia dan manfaatnya.
1.jmol

Jmol ini gartis, merupakan penampil strukutur molekul tiga dimensi (molecule viewer) yang dapat digukan secara bebas oleh siapapun yang menekuni bidang kimia dan biokimia. Aplikasi ini merupakan cross-platform, berjalan di sistem operasi Windows, Mac OS X, dan Linux / Unix. Fitur yang dimilikinya di antaranya membaca berbagai jenis file dan output dari program kimia kuantum, dan animasifile multi-frame. JmolApplet adalah applet web browser yang dapat diintegrasikan ke dalam halaman situs. Aplikasi Jmol adalah aplikasi Java standalone yang berjalan di desktop. JmolViewer merupakan seperangkat alat yang dapat diintegrasikan ke dalam aplikasi Java lainnya.

Untuk menggunakannya silahkan download dan ekstrak file downlad-annya. Klik file Jmol.jar (di PC mestinya tersedia Javaruntime terlebih dahulu). Buka file yang support untuk dibuka dengan Jmol.

2.ACD/ChemSketch Freeware (Platform : Windows, Linux)

Chemsketch adalah software grafis untuk menggambar hal yang ada hubungannya dengan kimia . Bisa menggambar secara manual atau menggunakan templet yang disediakan. Klik dan gambar molekul, ion, stereobonds, teks, poligon, panah, serta perlengkapan laboratorium, dll termasuk menentukan secara otomatis massa suatu atom atau molekul. Kita juga dapat memperkirakan densitas, indeks bias, volume molar, dll.  Selain itu dari ACDLabs juga menawarkan beberapa download gratis untuk utilitas yang dapat dipergunakan dalam ChemSketch sehingga lebih powerfull.

Untuk dapat mendownload software ini diperlukan registrasi (sebentar hanya memasukan beberapa data alamat email dan lain-lain). Setelelah download lakukan instalasi sebagaimana biasa dan siap untuk digunakan.

 3.Molegro Molecular Viewer (Platform: Windows, Linux, dan Mac OS X)

Aplikasi gratis dengan multiplatform yang digunakan untuk visualisasi molekul dalam format PDB, SDF, Mol2, dan MVDML. Fiturnya meliputi pembuatan molekul secara otomatis, visualisasi permukaan molekul dan backbone.

Ukuran file untuk windows sebesar 5,52 MB

Ukuran file untuk windows sebesar 9,41 MB

Untuk MacOSX saya belum coba, menungggu untuk punya MacOSX dahulu, bagi yang mau menyumbangkan Mac-nya untuk saya, dengan senang hati saya menerimanya :) .

Untuk file-file dengan ekstensi pdb, bisa dibuat sendiri dengan aplikasi di atas atau men-download-nya dari elchem.kaist.ac.kr. Model molekul yang tersedia di situs ini adalah molekul-molekul organik dari yang paling sederhana hingga yang cukup kompleks

4.Symyx Chime dan Symyx Draw (Platform: Windows dan MacOSX, Linux belum tersedia)

Kedua aplikasi ini gratis (no fee) siapapun boleh mengunduhnya dan memakainya secara cuma-cuma. Sebelum mengunduhnya diharuskan melakukan registrasi dengan mengisikan beberapa data yang empunya situs perlukan. Sayang untuk platform linux belum tersedia jadi mesti menggunakan Wine agar bisa menjalankannya di linux. Kedua software ini saling melengkapi sehingga kita bisa memanfaatkannya dalam program pengajaran di kelas untuk mata pelajaran kimia.

Symyx Chime versi 2.6 SP8 berformat zip berukuran 3,9 MB. Chime merupakan plug-in yang secara interaktif menampilkan molekul 2D (dua dimensi) dan 3D (tiga dimensi) langsung di halaman Web. Kita juga dapat memutar, memformat, dan menyimpan molekul untuk digunakan dalam program lain.

Symyx Draw versi 3.3 berukuran cukup besar dalam format zip (66 MB). Dengan aplikasi ini kita bisa menyisipkan model molekul yang kita buat ke dalam halaman situs, dokumen, spreadsheet maupun presentasi.

5.ChemToolbox

Fitur: ChemToolBox memiliki beberapa alat bantu yang diperlukan oleh pekerja laboratorium. Ini berisi sifat pelarut, Kimia solusi, tabel periodik unsur, Biokimia, Spektroskopi, Perhitungan dan unit. Kotak alat ini ditujukan kepada khalayak luas yang mencakup mahasiswa, PhD atau bahkan ilmuwan senior. Ini dapat memberikan data yang paling baik dibandingkan bila Anda harus membutuhkan beberapa buku pegangan dan mencari database on-line. Dapat memberikan bantuan dengan termasuk kimia organik (sifat pelarut, miscibility dan polaritas, pendingin campuran), larutan kimia (asam / basa dan pasangan redoks, indikator berwarna, kompleks, garam, fluorochroms), spektroskopi (1H dan 13C NMR) atau polimer kimia), basa nitrogen biokimia (asam amino, karbohidrat, asam lemak, SDS-PAGE), dll memiliki perhitungan dan unit konversi alat yang dapat menggunakan konstanta ilmiah. Satuan yang digunakan adalah sistem SI.

Data dapat diekspor dalam HTML. Selain pilihan pengaturan tampilan dalam HTML, ChemToolBox memungkinkan standar dan data opsional untuk diekspor. Ekspor data opsional dapat dilakukan dengan mencentang kotak yang terkait dan dengan mengklik OK untuk memvalidasi pilihan. kustomisasi Beberapa kemungkinan yang mencakup Minimalkan aplikasi di SysTray: opsi ini memungkinkan untuk membiarkan aplikasi tersebut aktif di SysTray dengan menampilkan ikon ChemToolBox. Aktifkan ujung balon SysTray memungkinkan jendela informasi yang akan ditampilkan bila ChemToolBox diminimalkan dalam SysTray. Gaya menu dapat diubah dengan tema Windows Vista, XP, Office 2007, dll

Kesimpulan : Sangat luas database yang berguna dalam untuk bekerja sehari-hari dan dengan interface yang bersih, ini adalah bagian pekerjaan benar-benar baik.

6.ChemLab

ChemLab adalah sebuah software program fisual alat-alat laboratorium dan simulasi praktikum di laboratorium.


7. MarvinSketch

Banyak hal yang bisa dimanfaatkan dari MarvinSketch untuk pengajaran kimia. Gambar dan animasi molekul dapat dibuat dengan mudah. Selanjutnya dapat disisipkan dalam media pembelajaran kimia. Tutorial berupa video untuk mengefektifkan. MarvinSketch adalah software kimia hanya untuk visualisasi rumus struktur kimia yang gratis, bisa dijalankan di sistem operasi Windows dan Linux juga MacOS.


8.Kalzium

Kalzium adalah nama sebuah software (open source software - OSS) yang memanfaatkan tabel periodik untuk mengeksplorasi setiap unsur. Tapi ternyata tidak sekedar tabel periodik biasa, lebih dari sekedar tabel periodik. Kalzium berasal dari bahasa Jerman dari kata kalsium. Saat ini Kalzium sampai di versi Hidrogen. Untuk diketahui semenjak Kalzium menjadi aplikasi standalone ia versinya akan dinamai dengan urutan nama unsur dalam tabel periodik.Materi-materi pelajaran kimia, baik di kelas 10, kelas 11 IPA, maupun kelas 12 IPA bab-bab tertentu sangatlah tepat memanfaatkan kehebatan Kalzium. Tentu ini hanya merupakan alternatif dalam penggunaan media pembelajaran. Sampai saat ini Kalzium belum mendukung untuk sitem operasi Windows. Hanya bisa berjalan untuk sistem operasi Linux. Oleh karena itu di sarankan pengguna yang ingin mencobanya sebaiknya meningstall sistem operasi Linux, gratis dan halal. Silahkan pilih distro yang disukai.