Beberapa toolbars yang harus dipahami dulu adalah Draw, Select, Rotate out-of-plane (XY Rotation), Rotate in-plane (Z Rotation), Translate (XY Translation), Z-Translate, Magnify/shrink/Zoom,Z-Clipping planes, dan Text Annotation. Penjelasannya sebagai berikut:
 |
: button `Drawing' untuk menampakkan sistem periodik unsur; cara melakukanya
Dengan klik 2 kali secara cepat: button `Selection' untuk memilih atom atau molekul atau untuk melihat panjang ikatan, sudut ikatan, dan sudut torsi
 |
: button `XY Rotation' untuk memutar molekul sekitar sumbu X dan Y
 |
: button `Z Rotation' untuk memutar molekul sekitar sumbu Z
 |
: button `XY Translation' untuk menggerakkan atom dan molekul sepanjang sumbu
X dan Y : button `Z Translation' untuk menggerakkan atom dan molekul sepanjang sumbu Z
: button `Zoom' untuk membesarkan atau mengecilkan sistem molekul. Caranya, tekan tombol kin mouse, gerakan ke kiri-bawah untuk membesarkan, atau gerakan ke kanan-atas untuk mengecilkan: button `Z Clipping' untuk memotong molekul
 |
: button `Text Annotation' untuk menambakkan text pada layar
PERSIAPAN MEMBUAT FILE STRUKTUR BARU
Langkah sederhananya :
Klik <File>, pilih <Preferences>, sehingga muncul tampilan berikut
Pilih pada <Window Color> <White>, supaya layar HyperChem berwarna putih.
Pilihan lain pada <Preferences> dapat dicoba sendiri.
Klik <Display>, pilih <Labels>, sehingga muncul tampilan berikut:
Pada <Labels> pilihlah <Symbol> dalam <Atoms>, lalu pilihlah <Bond Order> dalam Bonds>. Sementara pilihan manut dulu, lain kali terserah.
MEMBUAT STRUKTUR BARU
Langkah mudahnya:
Klik <File> lalu pilih <New>, supaya layar bersih
Klik button [Draw] 
2 kali dengan cepat sehingga muncul < Element Tabel>
2 kali dengan cepat sehingga muncul < Element Tabel>
Seumpama akan membuat struktur etana (CH3CH3), maka klik I kali huruf <C> pada <Element Tabel>. Ingat pilihan <Explicit Hydrogens> pada <Element Tabel> jangan dicentang (tidak dipilih dulu)
Pada layar putih klik kiri mouse 1 kali, kemudian klik kiri mouse I kali lagi dekat dengan yang pertama, seperti pada gambar
Klik kiri mouse pada C sebelah kiri, jangan dilepas dulu klik kirinya, geser atau hubungkan ke C yang kedua, sehingga terbentuk ikatan, seperti gambar berikut
|
Klik <Build> dan pilihlah <Add H & Model Build> sehingga muncul struktur berikut
Klik button toolbars yang lain untuk mengubah posisi stuktur, misalnya klik 1 kali button [XY Rotation] 
, kemudian pada layar putih klik kiri mouse dan tahan tents sambil menggeser mouse kesana-kemari. Coba pilihan lain, misal [translation], dan [zoom]
, kemudian pada layar putih klik kiri mouse dan tahan tents sambil menggeser mouse kesana-kemari. Coba pilihan lain, misal [translation], dan [zoom]MELIHAT PANJANG IKATAN, SUDUT IKATAN, DAN SUDUT TORSION
Klik <Select> dan pilihlah <Atoms>, untuk memilih atom-atom
Klik button toolbars [Select] 
1 kali saja
1 kali sajaUntuk melihat panjang ikatan, arahkan button [Select] pada garis ikatan tertentu, misalnya garis ikatan antar C, dan klik kiri mouse l kali tepat pada garis ikatan yang dipilih, maka akan muncul keterangan pada garis paling bawah layar seperti berikut ini
Jarak antar C adalah 1,54 Angstrom
Cobalah lagi pada garis ikatan lain, dan bacalah panjang ikatannya!
Untuk membebaskan kursor mouse dan memilih maka klik kanan mouse 1 kali di sembarang tempat.
4. Untuk melihat sudut ikatan H-C-H, maka klik kiri mouse dan tahan tepat di atas atom H pertama dan geserkan ke atom H kedua, lepaskan klik, dan lihat hasilnya.
Sudut antara atom nomer 6-2-7 (H-C-H) adalah 109,471°.
Coba antar 3 atom yang lain ! Misal sudut H-C-C !
5. Untuk melihat sudut torsi atom H-C-C-H, maka klik kiri mouse pada atom H pertama, tahan klik dan geserkan ke atom H kedua, sehingga muncul gambar berikut
Sudut torsi atom H-C-C-H adalah 180°
STRUKTUR 3 DIMENSI
Klik <Display>, dan pilihlah <Rendering>, muncul tampilan berikut
Pada Rendering Options terdapat berbagai pilihan : Rendering Method, Sticks, Balls, Cylinders, dan Overlapping Spheres. Misalkan pilihannya pada
Rendering Method : Balls and Cylinder
Sticks : Pilih semua, kecuali Stereo
Balls : Shading dan Highlight
Cylinder : Color by element
Overlapping Sphere : Shading dan Highlight
Maka akan diperoleh gambar 3 dimensi sebagai berikut:
Untuk berubah ke bentuk semula (misalnya Sticks) tinggal tekan tombol <F2>, bolak-balik!
Perlakukan bentuk gambar 3 dimensi ini seperti bentuk <Sticks>, misalkan untuk melihat panjang ikatan, sudut ikatan 3 atom, dan sudut torsi 4 atom pilihan. Gerakkan pula dengan <XY Rotation>, <Z Rotation>, <Translation>, atau <Zoom>
Untuk melihat gambar 3 dimensi yang bagus banget, maka klik <Display> dan pilihlah <Raytrace>
Jangan lupa simpan gambar strukturnya dengan memilih <File> dan <Save>, kemudian beri nama file (misal gambar 1).
MENGUBAH STRUKTUR MOLEKUL
Bagaimana membuat struktur Toluena dengan mengubah dari Benzena ?
Klik menu <File>, pilih <Open>, carilah file `Benzene' di direktori C:\Hyper80\ Samples\aromatic
Klik file `Benzene' dan <Open>, maka akan muncul struktur Benzena
Klik menu <Select> dan pilih <Atoms>, ingat jangan pilih dulu <Multiple Selections>, karena hanya akan memilih satu pilihan saja
Klik kiri mouse tepat di atas salah satu atom H sampai ada tanda lingkaran, tanda berhasil memilih, kemudian pilih tombol <Delete> pada keyboard
Klik button [Draw] 
2 kali dengan cepat sehingga muncul <Element Tabel>
2 kali dengan cepat sehingga muncul <Element Tabel>Klik 1 kali huruf <C> pada <Element Tabel>
Klik kiri mouse l kali tepat pada posisi atom H yang dihapus
Tarik garis ikatan dari atom C baru ke atom C yang dihilangkan atom H-nya, dengan cara menekan tombol kiri mouse tepat di atas atom C baru, tahan dan geserkan ke atom C yang hilang atom H-nya
Klik <Build> dan pilihlah <Add H & Model Build>
Klik button [XY Rotation] dan gerakan molekul sehingga atom H yang lain tampak
dan gerakan molekul sehingga atom H yang lain tampaksource:http://kimia.unnes.ac.id/kasmui/komputasi/diktat_hyper.htm
Tidak ada komentar:
Posting Komentar